Quatro meses após encerrar a carreira como jogador Evair teve a oportunidade de iniciar a carreira de treinador ao receber uma proposta do Vila Nova de Goiás. A equipe terminou a primeira fase do Campeonato Goiano em 1º lugar garantindo uma vaga na final. Porém, após ganhar o primeiro jogo por 2 a 1, o Vila Nova perdeu o título ao ser derrotado pelo CRAC em Catalão/GO, ficando com o vice-campeonato.
Evair passou um grande período preparando melhor a sua carreira de treinador, até que em 2007 acertou a sua ida para a Ponte Preta para exercer a função de auxiliar-técnico de Nelsinho Batista.
No ano seguinte, em janeiro, deixou Moisés Lucarelli e assinou com o Trindade (GO) para ser novamente técnico.
Depois foi contratado pelo Anápolis, e novamente mostrou que é um grande treinador levando o time as semifinais do campeonato estadual, no qual quase conseguiu surpreender o Goiás.
Em 2009 comandou outro time que iria disputar o Campeonato Goiano, desta vez o CRAC, onde também desempenhou um ótimo trabalho, chegando novamente as semifinais do torneio.
No ano de 2010 recebeu outra oferta do futebol goiano, e comandou o Itumbiara na disputa do primeiro turno do estadual. No mesmo ano aceitou o desafio de tentar salvar o Uberlândia nos seis últimos jogos do Campeonato Mineiro, porém não foi possível.
Em 2011, Evair atuou como auxiliar de Sérgio Guedes no Americana. Após ótima campanha, mantendo o time durante toda competição entre os quatro melhores, a comissão foi dispensada pela diretoria do clube.
Em 2012, Evair voltou ao futebol goiano para comandar novamente o CRAC, levando o time as semifinais do estadual, terminando a competição na terceira colocação, conquistando vaga na Série C do Campeonato Brasileiro.
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